部级科技创新平台
| 序号 | 平台名称 | 批准部门 | 依托学院 | 批准时间 |
| 1 | 水声通信与海洋信息技术教育部重点实验室 | 教育部 | 海洋与地球学院 信息学院 | 2005.12 |
| 2 | 高性能陶瓷纤维教育部重点实验室 | 教育部 | 材料学院 | 2009.12 |
| 3 | 滨海湿地生态系统教育部重点实验室 | 教育部 | 环境与生态学院 | 2007.12 |
| 4 | 计量经济学教育部重点实验室 | 教育部 | 王亚南经济研究院 | 2009.12 |
| 5 | 谱学分析与仪器教育部重点实验室 | 教育部 | 化学化工学院 | 2013.09 |
| 6 | 多媒体感知与高效计算教育部重点实验室 | 教育部 | 信息学院 | 2023.03 |
| 7 | 电化学技术教育部工程研究中心 | 教育部 | 化学化工学院 | 2006.08 |
| 8 | 微纳光电子材料与器件教育部工程研究中心 | 教育部 | 物理科学与技术学院 | 2007.1 |
| 9 | 分子诊断教育部工程研究中心 | 教育部 | 生命科学学院 | 2009.11 |
| 10 | 异质异构先进封装集成教育部工程研究中心 | 教育部 | 电子科学与技术学院 | 2024.11 |
| 11 | 传染性疾病检测技术研究与评价重点实验室 | 国家药监局 | 公共卫生学院 | 2021.02 |
| 12 | 闽台非遗文化数字化保护与智能处理文化和旅游部重点实验室 | 文化和旅游部 | 信息学院 建筑与土木工程学院 电影学院 | 2021.05 |
| 13 | 医用生物制品省部共建协同创新中心 | 教育部（省部共建） | 公共卫生学院 | 2019.09 |
| 14 | 台湾海峡海洋生态系统教育部野外科学观测研究站 | 教育部 | 海洋与地球学院 环境与生态学院 | 2019.09 |
| 15 | 国家能源用户侧储能创新研发中心（分中心） | 国家能源局 | 能源学院 | 2023.08 |
| 16 | 干眼医药基础研究创新中心 | 教育部 | 医学院 | 2023.05 |
| 17 | 表界面化学国家级国际联合研究中心 | 科技部 | 化学化工学院 | 2007(2025年重新认定) |
| 18 | 海洋环境科学国际科技合作基地 | 科技部 | 海洋与地球学院 | 2009(2025年重新认定) |
